Pesquisando acabei de descobrir algo que jamais imaginava..
Na realidade quando você cria um projeto, junto você está criando um objeto Application, descendente da classe TApplication. Este objeto é um form com dimensões 0x0, ou seja, invisível, mas não hide. O que você vê na barra de tarefas é o título deste form invisível que tem com caption o mesmo nome do projeto. Ele é que controla todos os outros forms do projeto. Assim ao clicar nele o principal é mostrado. Desejando que os dois tenham o mesmo nome(caption) temos o código acima.
CODE
Application.Title:=Form1.caption
Porisso é que os nomes são diferentes, pois na realidade existem dois forms logo de inicio.
Foi isso que eu entendi na leitura que fiz.
Querendo comprovar a existência deste form coloque num form qualquer um botão e nele o código abaixo:
(Antes diminua bastante o tamanho do form principal)
CODE
var
OldStyle:Integer;
begin
OldStyle:=GetWindowLong(Application.Handle,gwl_Style);
SetWindowLong(Application.Handle,gwl_Style,OldStyle or WS_THICKFRAME or WS_CAPTION);
SetWindowPos(Application.Handle,0,0,0,200,100,SWP_NOMOVE or SWP_NOZORDER);
end;